张锋 CRISPR-Cas9 基因编辑技术 的 专利官司今天出结果了。美国专利局法庭（注一）宣布张锋获胜。 众所周知， Doudna 在2012 年六月发表论文，首次报道运用 CRISPR-Cas9 在试管中实现 DNA片段的切割。6个月后的2013年 一月，张锋的研究小组发表论文，在人类细胞中用 CRISPR-Cas9 实现基因编辑，并很快申请了专利。2016年3月，Doudna 提出专利干扰诉讼，称张锋的发明是在她的专利基础上显然的事情。据报道，双方为了专利诉讼花了千万美元的律师费。 在此之前，我对张锋的了解仅仅是在韩春雨事件中听过其名而已，而且似乎有人对他的名气还存在疑问。在阅读相关资料后，我发现张锋才是 CRISPR -Cas9 技术的集大成者。围绕双方的争议，我写了若干博文。介绍了CRISPR-Cas9 基因编辑技术，也分析了张锋与DOUDNA在 CRISPR-Cas9 的专利官司。相关介绍参见：《 张峰专利官司科普及案情发展-叛逃者将被 UC 传讯 》《 CRISPR 基因编辑技术及张锋的贡献 》《 CRISPR基因编辑技术的显然性分析 》《 CRISPR基因编辑研究秘辛大起底 》《 发自张锋实验室的四封CRISPR邮件 》。 在 CRISPR 基因编辑技术及张锋的贡献 一文中，我结论到 【 张锋首次将 CRISPR-Cas9 成功用于高等生物的基因编辑，其主要成果是基于2011年 Charpentier 的 tracrRNA 发现 】。在2012年初，也就是 Doudna 论文发表前半年，张锋就已经提交了完整的真核细胞基因编辑设计。张后来的论文结果基本是基于这个设计。 事件中，张锋实验室还出了一个中国留学生背叛者，向 DOUDNA 提供内部消息。但这个学生提供的电子邮件等信息恰恰证明张锋在 2012 年初就开始了相关真核细胞的基因编辑研究，并且明显找到了关键。而 DOUDNA 在 其2012年论文发表之后数个月仍未能成功实现真核细胞的基因编辑，直到张锋合作伙伴 CHURCH 提供了真核编辑的数据之后才获得成功。 根据张锋所在布罗德研究院的声明，美国专利局法庭在 2月15日宣布， Doudna 针对张锋的真核细胞 CRISPR-Cas9 基因编辑技术的专利干扰诉求不成立 。美国专利局判决称： Doudna 与 Vilnius 的专利申请只是在试管中剪切DNA片段，没有涉及细胞、基因组，也没有基因编辑.（ The applications filed in 2012 by the Vilnius team and the Berkeley team each showed only that purified Cas9 protein and a certain purified RNA could cut a short piece of DNA in a solution in a test tube. In both cases, the applications in 2012 contained no cells, no genomes, and no editing.） Vilnius 的专利申请只是自然系统不能申请专利 （专利必须是人脑的创造，自然现象不能申请专利） （The USPTO rejected the Vilnius application as not having significantly more than a study of the natural system and failing to describe invention.） 张锋的真核细胞基因编辑专利不受 Doudna 专利影响。 对相关技术感兴趣的读者可以参阅《 CRISPR基因编辑技术的显然性分析 》等博文。另外，科技时代，科学技术是财富。据报道，去年 Doudna 专利官司启动后，张锋的 EDITAS 公司股价从 $ 42 开始大跌，最低只有13。今天 EDITAS 大涨 30%，达到 $ 24。张锋的财富量在10年内可能超过美国总统川普家族。 虽然科学研究的目的是为人类文明做贡献，而不是获取，但能用科技智慧创造财富也许更能够激励人们进行科学探索。 judgement-motions.pdf 注一：读者可能问，专利局怎么有法庭，这个问题我在之前解释过。
刚看到霜天贴 白宫"反歧视华人歌曲"请愿签名，我签名之后，读了一下歌词，觉得这过于 offensive ，而且可能是违法的。但仔细想想，美国华人本身也应该反省。 这首歌的作者是黑人RAP歌手YG。据他说，他曾因入室盗窃坐牢，这首歌是分享他的经验，对于美国西海岸的他们来说，入室盗窃是青少年的文化的一部分，他自己就这么做了（也坐牢了）（ i n 2014 he told FM magazine in that he wrote the song in order to "share the experience (of breaking into houses) with the people, because that's a part of the culture. Especially where I'm from, in L.A., the west coast, that's a big part of the culture of a teenager or someone in their mid-20s, that's what they doin', they breaking into houses. That's what I did ." ） YG歌词写道：【找个中国人居住区，因为他们不信银行账号... 确认没有人在家。他们走了，OK，可以开始了。不要害怕，黑鬼，你进去了...】歌词还描写了怎么偷走电视、笔记本、珠宝等等，偷完之后跑去花十块钱喝点 Icy 吃个麦当劳，等等。歌词还写道：【如果你一辈子偷过东西，制造点噪音。不要羞愧，it is okay，baby。如果你曾经从你妈妈钱包里偷过一块钱，就弄出点声响。】估计这个YG坐牢时得到过母亲的谅解与安慰，年纪轻轻就进了监狱，也可怜。我曾在罗马被吉普赛人偷走至少两千美金，想了想，唉，让他们拿去吃几顿饱饭、喝点酒、PARTY 高兴一下也好，至少没有把我证件给拿走害得我行程陷入困境。 前些天，有个台湾来的、哈佛毕业的、纽约时报记者在大街上被一位白人女士说：“回中国去”（有些人翻成“滚回中国”，我觉得没有这么不文明）。 此人很不爽，说他不是共产中国来的，我出生在美国，为什么要我走啊 ？这个人不知想过没有，白人女士可能对一位黑人男子说这种话吗？ 从政治地位看，美国黑人男性在1870年就获得了投票权 （15th Amendment to the U.S. Constitution）。而美国白人女性在半个世纪之后的1920年才获得投票权（19th Amendment），而且这是在俄国革命赋予苏联妇女投票权之后。中国人呢。1882年，美国联邦设立《中国人排除法》，禁止中国人移民美国。《中国人排除法》虽然在1943年因为二战结盟中国的需要被废除，但并没有根本的改变，中国人移民限制在每年105人（一百零五人）。美国是尊重人权的，但人权是给人的。二战后加州《中国人非人》的宪法人权条款依然是加州的最高法律。 当年美军在朝鲜最大的震撼就是在于真正汉人给他们的心理反差。阿尔蒙德给部下若干悍将的训导是："Don't let a bunch of Chinese laundry-men stop you."(别让一帮中国洗衣工拦住你），众将应该大笑。结果接下来，美军发现中国人根本不是唐人街看到的那样，而是非常 aggressive。美军战史记载，很多美军在逃跑中对前进的美军大喊：“快跑，大群老中追杀上来了。” 。。。 加州的《中国人非人》的宪法人权条款是在朝鲜战争之后才得以废除。所以，我们也说 朝鲜战争是一场在国际上确立中国人人权的战争 。而美国第一个以 中国人命名的法案《贺梅法案》到 2007年才出现 。 但是，对于很多老一代的美国民众来说，他们从小受到的耳濡目染已经在他们的心中形成思维定式，他们眼里的中国人还是以前唐人街的那种逆来顺受的形象。这也就难怪还有很多人轻视中国人，轻视中国男人。 那个哈佛中国青年男子被白种女性说“go back to China”尤其应该令中国男性感到沮丧。这说明中国男普遍缺乏 SEX APPEAL，在西方具有相对较低的 MATING OPPORTUNITY 。从照片上看，哈佛男长相还不错、又是哈佛毕业，为什么这么不济呢？也许少了点阳刚之气？ 相比之下，《 湖南农民坐自行车搞定瑞典美女 》故事中，薄瓜瓜读了哈佛开着法拉利也搞不定美国大使领养的女儿，莫言《丰乳肥臀》里的瑞典神父搞得女教徒神魂颠倒；湖南衡山农民杨顺一天坐在朋友的自行车后座上，在校园里看到一位正在跑步的美女， 杨顺感叹了一句：“这个妹子真性感！ ” .... 看来光有钱、有文凭是不够的，得有魅力。 魅力从哪里来？我觉得啊，首先应该有自信、说话算数等等基本品质。 某些华人考试作弊、论文抄袭（像什么拿西方设计图抄抄跑到国内发18篇论文），跟黑人偷东西有什么两样呢？ 可能问题更严重。自己心里有鬼，也就不敢面对 truth。 反对鼓吹盗窃当然没错，但各种作弊行为，华人社区好像并没有强烈的谴责、反对。这是我们应该反思的。 补充：看到YOUTUBE上有华人也模仿黑人搞了个RAP，大骂黑人，这算什么呢？？华人应该学会参与社会，而不是对穷苦的黑人宣战。我的评论是： This is even more stupid than the YG song. The YG song sang about burglary and sad reality of life of the black youth. This song contains more violence and insults. Are you advocating a race war between the Chinese and the blacks? Both the Chinese and the blacks were oppressed people. But today Chinese is the only non-white race that possesses thermo-nuclear weapons and manned space technology. The Chinese should promote civilization and understanding.
我在《 余秀华的呐喊与瓦格纳的N次高潮 》中写道：【 直接把潜意识里的渴望喊了出来。】 “潜意识”顾名思义，与“无意识”是不同的。 如果稍微思考一下就应该想到不同的词之所以不同应该是在表达不同的含义，毕竟意思完全相同的词是很少见的。但某些 没有足够教育而且智力先天不足的人往往有个显著问题，那就是无法正确区分表面相似却不同的概念。 我指出这一点之后，iMan 在网上抄了一段英文， "潜意识“ 。 这段话说的不错，但要读懂这段话又需要一定的英文阅读理解能力，大约需要中国的高中英语程度。这句话 准确翻成汉语是【潜意识是我们当时没有主动察觉到但是能影响我们的信息】。换言之，潜意识的信息（1）并非无法意识到，而只是（某个思维过程）当时没有主动意识；（2）潜意识可能在人的行为中（包括语言表达）中不自觉的表现出来。 要理解上面的（2）必须区分“意识”与“行为”。说话是一种行为，是人体发声器官进行一系列运动的结果。这个行为是否由主动意识控制是另外一个问题。 所谓 Freudian slip 就是一种常见的清醒状态下潜意识的语言表露。酒后吐真言在某些情况下也可能是潜意识的宣泄，醉酒的人自己都不记得，甚至不知道自己在说什么，但却可能说出了内心底层的东西。梦话也可能是没有主动意识，而是潜意识的表达。对此，弗洛伊德等人早就进行过研究，有兴趣的可以阅读其著作。我们上大学是读过一些的。但弗洛伊德的东西顶多只是现象学，没有给出物理、生理机制。 如果把人脑看成一个并行运算的计算机，那么人正在进行的思维可能其运行的主线程 (main thread)，而潜意识可能是另一条或者多条计算线程（worker threads)，后者的运行过程中有可能改写主线程正在使用的数据，这在计算中是常见的数据 memory coherence 问题，需要使用各种同步机制才能确保数据的一致性。多线程的程序如果没有特别小心的处理，往往会出现很难解释、也很难重复的bug。人脑的主线程可能控制了数据输入输出(I/O)的接口(interface) -- 如听觉与发声器官，但潜意识线程对数据的修改可能导致以上提到的潜意识被输出的现象，当然潜意识线程也可能导致输入处理的错误---如听错话、记错事情等。( A Multi-threaded Computing Model for the Subconscious) 下面是部分讨论。 iMan : "直接把潜意识里的渴望喊了出来。（岳东晓语）" 这是弱智装X的活标本。 岳博士，你还是跟我玩玩初中物理吧：《江雪三钓》 http://www.zhenzhubay.com/home.php?mod=spaceuid=20408do=blogid=27741 在文学艺术方面欺负你一理呆，胜之不武，我没有存在感。 iMan : 能“直接喊出来”的就不是潜意识了。 (1-19 05:35) 岳东晓 : 潜意识（subconscious) 不是无意识（unconscious) --- 尽管混淆这两个概念是一个常见错误。But their distinction is probably beyond the comprehension of your primitive mind. (1-19 06:47) iMan : 花言巧语，英文术语掩盖不了你的弱智装X的笑话！ “潜意识，心理学术语。是指人类心理活动中，不能认知或没有认知到的部分，是人们“已经发生但并未达到意识状态的心理活动过程”。” ZT 不能认知或没有认知的部分可以直接喊出来？你有起码的逻辑能力吗？ (1-19 06:58) 岳东晓 : 混淆这两个概念是一个常见错误，你所引用的定义正是这种错误的表现。But their distinction is probably beyond the comprehension of your primitive mind. (1-19 07:05) iMan : “unaware of” 的信息如何直接喊出来？呵呵。你只能忽悠不识英文的文傻。 “In the field of psychology, the subconscious refers to that part of consciousness that we are unaware of. It is information that we are not actively aware of in the moment, but that can influence us nonetheless, such as things that are heard, seen or remembered. The unconscious mind, on the other hand, is a term coined by Freud to refer to a part of the mind that cannot be known by the conscious mind, and includes socially unacceptable ideas, wishes and desires, traumatic memories and painful emotions that have been repressed.” http://www.diffen.com/difference/Subconscious_vs_Unconscious_mind (1-19 07:34) iMan : BTW, 关于《江雪三钓》 http://www.zhenzhubay.com/home.php?mod=spaceuid=20408do=blogid=27741 我已经提醒到这程度了，你还是连头也不敢伸一下？ “不需博士的专业物理，不需大学的普通物理，也不需要高中的高考物理，只需义务教育范围内的初中物理知识。” 初中物理，简单明确验证方便，没有弱智装X的空间。所以，你是坚决做缩头乌龟的。这是大智慧啊。 (1-19 07:38) 岳东晓 : Your primitive mind can't even comprehend what you have just copied pasted. (1-19 07:44) iMan : “unaware of” 的信息能否直接喊出来？ YES OR NO！ (1-19 07:47) 岳东晓 : State the reason why I should bother to look at this stuff complied by you the proven imbecile , who possesses neither originality nor adequate education. (1-19 07:52) 岳东晓 : You have to state your point instead of posing question before I am willing to educate you. (1-19 08:00) iMan : 岳东晓，“unaware of” 的信息能否直接喊出来？ YES OR NO！ 看你能无赖到什么程度！ 岳东晓 : You have to state your point instead of posing questions before I am willing to educate you. (1-19 08:04) iMan : 我的POINT在第一时间就明确说出来了："iMan: 能“直接喊出来”的就不是潜意识了。(1-19 05:35)" 能无赖到你这程度，确实令人敬佩你的超强的心理素质。 (1-19 08:06) 岳东晓 : As I stated, your primitive mind can't comprehend the distinction between the subconscious and the unconscious, and now you have proven my evaluation.You can't even understand what you copied pasted. Subconscious Of course, people may say things they are not actively aware of. The common term is Freudian slip. But I guess these words mean nothing to you. (1-19 08:15)
从不厚鞋底的摩擦系数讨论开始，引发了一系列有趣的问题。我在前面用初中物理分析走路时静摩擦力与步伐大小的关系（参见《 科普：走路的初中物理 》，以及 其续集 ），得出如下结果 这是一个相当简洁的公式，而且相当合理，摩擦系数为0，寸步难行的常识被这个公式牢牢抓住，而且最大步长小于2L，也通过了sanity检验。 上面公式可以改写为 S=\frac{D}{L} =2\frac{ \mu}{\sqrt{1+\mu^2}} ( 如果有读者看不到数学公式请举手 ）, 我们称S为相对步长，也就是步伐与腿长的比。将这公式倒过来， 我们得出 \mu = \frac{S}{\sqrt{4-S^2}} . 如果要画个曲线，是这个样子，横坐标是相对步长S，纵坐标是需要的摩擦系数，我们之所以要引入相对步长，并将S,\mu关系倒过来，是为了直观的跟实验结果比较， 有同学对上述初中物理得出的结果颇有微词。物理这东西，你要想不通，即使是初中物理也一样想不通。最好是实验说明。 GOOGLE 是我们的朋友，在网上一搜，找到这篇题为“Step length and required friction in walking”（步行步长与摩擦）的 2008年的论文， http://www.researchgate.net/publication/6135731_Step_length_and_required_friction_in_walking/file/60b7d515a20a67c903.pdf （ Ryan C. Cooper, et al. Department of Nutrition, Food and Exercise Sciences, Florida State University, Tallahassee, FL 32306, USA, Department of Biological Sciences, University of Calgary, Calgary, Alberta T2N 4N1, Canada, Department of Cell Biology and Anatomy, University of Calgary, Calgary, Alberta T2N 1N4, Canada)。这是美国与加拿大两所大学四名研究人员的实验结果，标题顾名思义，就是研究摩擦系数与步长的关系，其方法是找了一些人进行测试。他们得到的实验结果在论文中为图二，我拷贝于下 初中物理 理论的结果与美加大学研究者们的实验结果是相当一致的。 由此可见理论指导的重要性啊。 当然，我们初中物理的理论结果虽然与实验结果定性吻合很好，但是从定量的角度看还是略有区别的，实验中需要的摩擦系数要比理论值稍微小一些。 为什么呢？ 我在前面提到，我们的计算忽略了腿自身产生的力矩，这个力矩使所需要的摩擦力减少。而且显然，腿越粗这个修正越大。 可以肯定，把这个因素考虑进去，我们的理论（虽然还是初中物理）将与实验更加接近。 假设人一条腿占全身重量的比例为r （也就是 腿重为r*W)，我们的力矩平衡方程为 \frac{1}{2} W L \sin\theta = f L \cos \theta + r W \frac{L}{2}\sin\theta 由此得出， \tan \theta = \frac{2f}{(1-r) W} , 最大值为 \tan \theta = \frac{\mu}{1-r} , 如果我们引入一个量 u=\frac{\mu}{1-r} , 则有效步长公式为 u = \frac{S}{\sqrt{4-S^2}} ，换言之 \mu = \frac{(1-r)S}{\sqrt{4-S^2}} . 也就是说，考虑腿本身带来的力矩之后，步行而不滑倒所需的摩擦系数减少到原来的(1-r)倍。这也验证了一点，腿越重（也就是r越大），所需摩擦系数越小。也就是说，下盘粗的走路更稳。
历史学家GIBBON在《罗马帝国衰亡史》中记载基督教的历史时说：理性思维向来不是教徒们的长项。信乎！ 刚看到UPS 转帖的一位教徒的发言 ：【见得太多理工男，固步自封，自以为是，思想极为僵化偏执，觉得自己知道的就是终极真理，拒绝接受任何新的信息。真的很可悲！我们的教育里面缺乏人文方面的熏陶，如果自己不注意，去自我学习，自然就是这个悲摧的样子... 真是一点儿教养和涵养也没有，比引车卖浆者流还不如，因为他们还有两种品质叫谦卑和朴实。】 既然这位教徒引用了维基百科上关于牛顿的宗教信仰， http://en.wikipedia.org/wiki/Isaac_Newton's_religious_views 作为依据，那就让我们看看维基百科里面是怎么写的。" Newton's view has been considered to be close to deism and several biographers and scholars labeled him as a deist who is strongly influenced by Christianity." 这里面有一个词， DEISM ，懂点西方文明、西方思想史的应该知道这个词。DEISM的中文翻译是“自然神论”。 也就是说，这位教徒自己引用的资料明确将牛顿的信仰定为自然神论。自然神论显然不是基督教。 牛顿那个时代，欧洲人生下来就是基督徒，不信基督是可能像布鲁诺一样被教会绑在十字架上活活烧死的。牛顿从小受的是基督教教育，当然受到基督教的影响。作为 自然神论者，牛顿承认有个造物主，但是否定教廷的其他一切，包括否定耶稣与三位一体。 维基百科这个条目写得非常清楚：“ 'In Newton's eyes, worshipping Christ as God was idolatry , to him the fundamental sin'. As well as being antitrinitarian , Newton allegedly rejected the orthodox doctrines of the immortal soul 。” 我准确的翻成中文如下：“在牛顿眼里，把基督当成神来崇拜是偶像崇拜，是根本的罪恶。牛顿而且反对三位一体说，反对教会关于灵魂不死等正统教条。” 什么叫偶像崇拜（ idolatry ） ，教徒们应该懂的，那是大罪。 牛顿把信基督当成了 idolatry 扔进了垃圾堆。 DEISM是西方文明在去基督教过程中的一个初级阶段。 我在佳音教会的结辩中指出，【Thomas Paine 相信自然神. George Washington，你找不到他信基督教的证据...美国的前五位总统，有四位是不信基督的。Thomas Jefferson说了基督一些不很正面的话，我就不说了。James Madison也是信自然神的。】我说的信自然神，就是说的DEISM。 按照美国政教分离的原则，政府是不准搞宗教活动的，在公立学校学圣经、念圣经是违法的，在政府办公室贴摩西十诫也违法。 美国学校升旗的时候说"One nation under God”并不是基督教的那个GOD。DEIST们相信的God与基督徒们相信的God实际是两回事，其中关键差别之一是否相信particular providence. 至于美国总统就职手按圣经宣誓，这是一个传统习惯，并非规定 ，据我所知道的， Teddy Roosevelt 和John Quincy Adams 宣誓就职就没有用圣经。当然，也没有禁止使用圣经--但近年有美国人士提出不应用圣经。 爱因斯坦是否相信基督呢？且让我们引用他老人家回应教徒的话 （参见： http://en.wikipedia.org/wiki/Religious_views_of_Albert_Einstei n) “上帝这个词对我而言不过是人类弱点的一个表现与产物，圣经是一些可敬但依然原始的传说” （ "The word God is for me nothing more than the expression and product of human weaknesses, the Bible a collection of honourable, but still primitive legends. "）。
上大学时，正是中日围棋擂台赛热火的时候，我们在宿舍经常拿着黑白子对弈，而且输了是有代价的。当时学校食堂不仅有大锅煮的菜，还有单独的炒菜，称为小炒。我们下围棋，输的有时要给赢的买一个小炒。 围棋这东西跟其他棋类一样，输赢有个客观标准。围棋最后一点目就知道了。这没有什么好说的。也就是说，输了就是输了。 下棋的时候，当然是可以说话的。我们一般说一些刺激、调侃对方的话。比如说，“且看我追杀你这条大龙”，“你这一招真是黔技啊”，“上厕所都看棋谱、难怪这招臭”，“死背定式是不行的” 之类。 对方如果被说得情绪被调动，一激动，这一边往往就赢了。哈哈。 大学毕业后，我回老家在一个学校教了一年书，每天事情不多，就跑到益阳街上的棋摊上下棋，回家之后，研读棋谱，实战经验相当丰富。一年后，我因为要办签证去北京，见到不少同学（留在北大读研究生的）。其中一位说自己经常跟高手下棋，棋力大增，北京业余冠军谁谁谁也只能让我两子，你肯定不是我的对手了。我说我们下一盘？下了一盘，我赢了；再来，我又赢了。这同学急了，说没有一点刺激性就没有动力，要赌“巨小炒”才行。所谓“巨小炒”就是三个小炒。我说，好啊，我倒看看我这棋摊上的棋力跟北京市的高手比比如何。一下，他还是输了。 其实，从技术角度，这位同学的棋力确实比我高（当然我不会讲）。但问题是他往往自己犯错误。吴清源有句颇有哲理的话：下棋就是犯错，连续下棋就是连续犯错。我虽然没有跟高手较量过、棋力可能差点，但心理素质还行，即使知道落后，也不动声色，直到对方出错。正所谓孙子曰：故善战者，先为不可胜，以待敌之可胜；不可胜在己，可胜在敌。哈哈。总之，结果是：他输了。这叫做心理优势。 若干年后，我在美国联邦法院起诉一美国公司侵犯知识产权。陪审团审判一开始，对方律师就使出各种招术，包括很多影射性的攻击。换上别人，可能被他们气得吐血。我一看，就这几下就想激怒我啊，太小菜了。在证人席上我对被告律师非常客气，没有任何敌意。第二天在法庭上，被告律师（对方主打律师、证人全都是蓝眼白人）走到我前面递来一份证据文件，要我查看，我听到嗖嗖作响，一看，那律师拿着纸的手在剧烈地发抖。 我接过文件，很客气、而且略带同情地微笑道：“Thank you . Counselor." 整个官司结束后，我跟被告律师握手，笑道：”Thank you for the good fight."
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